Ligesom i den første fri træning var det her i den anden også Michael Shank Racing der satte tempoet med deres Ford Riley Daytona Prototype racere, denne gang satte teamet endda de to bedste tider, med #6 foran #60 - kun 0,018 sekunder skilte de to teamkollegaer. Blandt deltagerne i GT klassen var det Mazda RX-8 kørerne fra Dempsey Racing/Team Seattle der satte hurtigste tid, en tid der placerede dem på 13. pladsen i den samlede stilling.
Jan Magnussen der denne weekend stiller til start for Stevenson Motorsports i en Chevrolet Camaro i GT klassen sammen med Robin Liddell og Andrew Davis sluttede den anden fri træning på Daytona med en 20. plads i den generelle stilling, samt en 8. plads i GT klassen.